Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opn4Q9QXZ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Opn4Q9QXZ9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn4Q9QXZ9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn4Q9QXZ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms