Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nr2e3Q9QXZ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nr2e3Q9QXZ7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2e3Q9QXZ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nr2e3Q9QXZ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr2e3Q9QXZ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr2e3Q9QXZ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr2e3Q9QXZ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr2e3Q9QXZ7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms