Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cbx8Q9QXV1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx8Q9QXV1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx8Q9QXV1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx8Q9QXV1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cbx8Q9QXV1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms