Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cln8Q9QUK3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cln8Q9QUK3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms