Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scamp4Q9JKV5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scamp4Q9JKV5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scamp4Q9JKV5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp4Q9JKV5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms