Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacng3Q9JJV5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng3Q9JJV5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacng3Q9JJV5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacng3Q9JJV5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacng3Q9JJV5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacng3Q9JJV5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacng3Q9JJV5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacng3Q9JJV5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacng3Q9JJV5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacng3Q9JJV5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacng3Q9JJV5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacng3Q9JJV5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms