Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl28Q9JIL2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl28Q9JIL2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms