Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LratQ9JI60 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LratQ9JI60 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LratQ9JI60 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms