Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Tssc4Q9JHE7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Tssc4Q9JHE7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Tssc4Q9JHE7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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Tssc4Q9JHE7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tssc4Q9JHE7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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Tssc4Q9JHE7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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Tssc4Q9JHE7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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Tssc4Q9JHE7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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Tssc4Q9JHE7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssc4Q9JHE7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Tssc4Q9JHE7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Tssc4Q9JHE7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tssc4Q9JHE7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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