Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Timp4Q9JHB3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Timp4Q9JHB3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Timp4Q9JHB3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Timp4Q9JHB3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.4 ms