Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Brd4Q9ESU6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
Brd4Q9ESU6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Brd4Q9ESU6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Brd4Q9ESU6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Brd4Q9ESU6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Brd4Q9ESU6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Brd4Q9ESU6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Brd4Q9ESU6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Brd4Q9ESU6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Brd4Q9ESU6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Brd4Q9ESU6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Brd4Q9ESU6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Brd4Q9ESU6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Brd4Q9ESU6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Brd4Q9ESU6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Brd4Q9ESU6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Brd4Q9ESU6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms