Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ush1cQ9ES64 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ush1cQ9ES64 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ush1cQ9ES64 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ush1cQ9ES64 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms