Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfcp2Q9ERA0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tfcp2Q9ERA0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfcp2Q9ERA0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms