Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ndufa8Q9DCJ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ndufa8Q9DCJ5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ndufa8Q9DCJ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms