Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cyp27a1Q9DBG1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cyp27a1Q9DBG1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cyp27a1Q9DBG1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cyp27a1Q9DBG1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp27a1Q9DBG1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp27a1Q9DBG1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp27a1Q9DBG1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp27a1Q9DBG1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp27a1Q9DBG1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp27a1Q9DBG1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp27a1Q9DBG1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms