Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf4Q9DAW6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf4Q9DAW6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf4Q9DAW6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms