Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU9

Znf654, Zinc finger protein 654, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf654Q9DAU9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf654Q9DAU9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf654Q9DAU9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf654Q9DAU9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms