Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem239Q9DA47 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem239Q9DA47 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms