Protein–RNA interactions for Protein: Q9D991

1700123K08Rik, RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123K08RikQ9D991 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700123K08RikQ9D991 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700123K08RikQ9D991 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700123K08RikQ9D991 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700123K08RikQ9D991 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.8 ms