Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms