Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D8Q6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D8Q6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms