Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Slc52a2Q9D8F3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Slc52a2Q9D8F3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Slc52a2Q9D8F3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Slc52a2Q9D8F3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Slc52a2Q9D8F3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Slc52a2Q9D8F3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Slc52a2Q9D8F3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Slc52a2Q9D8F3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Slc52a2Q9D8F3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Slc52a2Q9D8F3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Slc52a2Q9D8F3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Slc52a2Q9D8F3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Slc52a2Q9D8F3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Slc52a2Q9D8F3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Slc52a2Q9D8F3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Slc52a2Q9D8F3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Slc52a2Q9D8F3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Slc52a2Q9D8F3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Slc52a2Q9D8F3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Slc52a2Q9D8F3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Slc52a2Q9D8F3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Slc52a2Q9D8F3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Slc52a2Q9D8F3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Slc52a2Q9D8F3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Slc52a2Q9D8F3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Slc52a2Q9D8F3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Slc52a2Q9D8F3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Slc52a2Q9D8F3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Slc52a2Q9D8F3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Slc52a2Q9D8F3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Slc52a2Q9D8F3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Slc52a2Q9D8F3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Slc52a2Q9D8F3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Slc52a2Q9D8F3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Slc52a2Q9D8F3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Slc52a2Q9D8F3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Slc52a2Q9D8F3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Slc52a2Q9D8F3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms