Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c55Q9D816 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp2c55Q9D816 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c55Q9D816 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c55Q9D816 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp2c55Q9D816 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c55Q9D816 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c55Q9D816 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c55Q9D816 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c55Q9D816 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp2c55Q9D816 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp2c55Q9D816 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp2c55Q9D816 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp2c55Q9D816 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp2c55Q9D816 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms