Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Klhl40Q9D783 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl40Q9D783 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl40Q9D783 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl40Q9D783 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhl40Q9D783 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms