Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms