Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnbd2Q9D5U8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnbd2Q9D5U8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnbd2Q9D5U8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnbd2Q9D5U8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnbd2Q9D5U8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms