Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Spata1Q9D5R4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spata1Q9D5R4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spata1Q9D5R4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms