Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q9D5Q8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D5Q8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D5Q8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms