Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Speer4f1Q9D5Q6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Speer4f1Q9D5Q6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms