Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tubgcp4Q9D4F8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp4Q9D4F8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp4Q9D4F8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms