Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snrnp35Q9D384 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snrnp35Q9D384 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snrnp35Q9D384 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snrnp35Q9D384 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms