Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q9D2Q3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9D2Q3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9D2Q3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms