Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D1F3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D1F3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D1F3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D1F3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D1F3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D1F3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Q9D1F3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D1F3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D1F3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D1F3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9D1F3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9D1F3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9D1F3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D1F3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D1F3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms