Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syf2Q9D198 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syf2Q9D198 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms