Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Prkrip1Q9CWV6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prkrip1Q9CWV6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms