Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700029F12RikQ9CRB4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700029F12RikQ9CRB4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1700029F12RikQ9CRB4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700029F12RikQ9CRB4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms