Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cox16Q9CR63 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cox16Q9CR63 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cox16Q9CR63 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cox16Q9CR63 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Cox16Q9CR63 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cox16Q9CR63 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cox16Q9CR63 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cox16Q9CR63 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cox16Q9CR63 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cox16Q9CR63 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cox16Q9CR63 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cox16Q9CR63 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms