Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pop4Q9CR08 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pop4Q9CR08 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pop4Q9CR08 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms