Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp5f1Q9CQQ7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp5f1Q9CQQ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5f1Q9CQQ7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5f1Q9CQQ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp5f1Q9CQQ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms