Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndufb9Q9CQJ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ndufb9Q9CQJ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ndufb9Q9CQJ8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms