Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700029P11RikQ9CQ68 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
1700029P11RikQ9CQ68 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms