Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2a1Q99PM3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2a1Q99PM3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gtf2a1Q99PM3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2a1Q99PM3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms