Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim8Q99PJ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim8Q99PJ2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim8Q99PJ2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim8Q99PJ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim8Q99PJ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim8Q99PJ2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim8Q99PJ2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim8Q99PJ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim8Q99PJ2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim8Q99PJ2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim8Q99PJ2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim8Q99PJ2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim8Q99PJ2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim8Q99PJ2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.5 ms