Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gtf2ird2Q99NI3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2ird2Q99NI3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2ird2Q99NI3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms