Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BrapQ99MP8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BrapQ99MP8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BrapQ99MP8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BrapQ99MP8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BrapQ99MP8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms