Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gtpbp4Q99ME9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtpbp4Q99ME9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp4Q99ME9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms