Protein–RNA interactions for Protein: Q99M02

March2, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH2, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March2Q99M02 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
March2Q99M02 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
March2Q99M02 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
March2Q99M02 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
March2Q99M02 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
March2Q99M02 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
March2Q99M02 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March2Q99M02 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March2Q99M02 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March2Q99M02 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
March2Q99M02 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
March2Q99M02 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March2Q99M02 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March2Q99M02 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March2Q99M02 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
March2Q99M02 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms