Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcf2Q99LE6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcf2Q99LE6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Abcf2Q99LE6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcf2Q99LE6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms