Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdxdc1Q99K01 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdxdc1Q99K01 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdxdc1Q99K01 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms