Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd1bQ99JY6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1bQ99JY6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1bQ99JY6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Higd1bQ99JY6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms